第二期數位學習深耕計畫分有大學與中小學兩個分項計畫，引導國內各級學校順應數位教育之需求及未來發展趨勢，建置數位教育的基本量能。本計畫為大學分項計畫，推動大學聯盟深化數位學習推展與創新應用，鼓勵大學校院跨校合作，建立合作推展數位學習的聯盟。在夥伴學校協力中心學校達成聯盟任務的過程中，建置及完備學校的基礎環境；中心學校在協助夥伴學校達成任務的同時，推展數位學習創新應用，以不斷精進數位學習的推展。